Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms