Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms