Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX2Q9UBZ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms