Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms