Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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