Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6BQ9NRW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms