Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms