Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF541Q9H0D2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms