Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms