Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms