Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D3Q587I9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms