Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC1A5Q15758 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A5Q15758 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms