Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms