Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms