Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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