Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 SVS1YPL163C 783 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YPL182CYPL182C 384 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 MCM10YIL150C 1716 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 HAL9YOL089C 3093 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YDR029WYDR029W 315 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YPL044CYPL044C 549 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 MLP2YIL149C 5040 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 THO2YNL139C 4794 nt0.13□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.12□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.12□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.12□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 WIP1YDR374W-A 270 nt0.11□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YGR290WYGR290W 444 nt0.11□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 RPB10YOR210W 213 nt0.11□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 PET111YMR257C 2403 nt0.11□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 snR72snR72 98 nt0.1□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 NFU1YKL040C 771 nt0.1□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YBR206WYBR206W 324 nt0.1□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 PRP5YBR237W 2550 nt0.1□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 NIP100YPL174C 2607 nt0.1□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YIR044CYIR044C 186 nt0.09□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 RPS27AYKL156W 249 nt0.09□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 INP2YMR163C 2118 nt0.08□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 OLI1Q0130 231 nt0.08□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 RPS20YHL015W 366 nt0.08□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 VIK1YPL253C 1944 nt0.08□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 SNU56YDR240C 1479 nt0.08□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 MLP1YKR095W 5628 nt0.07□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.07□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 EMC4YGL231C 573 nt0.07□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 TSC3YBR058C-A 243 nt0.07□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YAP6YDR259C 1152 nt0.06□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 TIM13YGR181W 318 nt0.06□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YJR011CYJR011C 786 nt0.06□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.06□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 CUL3YGR003W 2235 nt0.06□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 OST4YDL232W 111 nt0.05□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.05□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YOL014WYOL014W 375 nt0.05□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 snR51snR51 107 nt0.05□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 RCO1YMR075W 2055 nt0.05□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 PBI2YNL015W 228 nt0.04□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.04□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.03□□□□□ -2.4
HRD1Q08109 YCR001WYCR001W 315 nt0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 SDH7YDR511W 402 nt0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YDL011CYDL011C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YML108WYML108W 318 nt0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 PAA1YDR071C 576 nt0□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 PRP42YDR235W 1635 nt0□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 MAM33YIL070C 801 nt0□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 COX5BYIL111W 456 nt-0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YLR269CYLR269C 351 nt-0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 SPO21YOL091W 1830 nt-0.01□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YOR345CYOR345C 351 nt-0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 ORC3YLL004W 1851 nt-0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 PTP2YOR208W 2253 nt-0.02□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.03□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 QCR9YGR183C 201 nt-0.03□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.03□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 YOR053WYOR053W 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
HRD1Q08109 ATG31YDR022C 591 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YMR321CYMR321C 318 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YBL071CYBL071C 309 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YNL211CYNL211C 261 nt-0.04□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 RPS26AYGL189C 360 nt-0.05□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 GPI15YNL038W 690 nt-0.05□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YFL012WYFL012W 447 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YHL041WYHL041W 450 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 RPF1YHR088W 888 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YLR171WYLR171W 390 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YNL058CYNL058C 951 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 LEE1YPL054W 906 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YPL229WYPL229W 621 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 BUL2YML111W 2763 nt-0.07□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 ULI1YFR026C 510 nt-0.08□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 snR190snR190 190 nt-0.08□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 SOV1YMR066W 2697 nt-0.08□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.09□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 YNL146WYNL146W 303 nt-0.09□□□□□ -2.42
HRD1Q08109 COG8YML071C 1824 nt-0.1□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 RPL35AYDL191W 363 nt-0.1□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 ZEO1YOL109W 342 nt-0.1□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 MYO1YHR023W 5787 nt-0.1□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 NNF2YGR089W 2811 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 SSS1YDR086C 243 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YHR125WYHR125W 306 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YLR232WYLR232W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.11□□□□□ -2.43
HRD1Q08109 COY1YKL179C 2040 nt-0.11□□□□□ -2.43
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