Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms