Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 snR51snR51 107 nt1.03□□□□□ -2.24
UBX2Q04228 snR72snR72 98 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YBR285WYBR285W 435 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 LCD1YDR499W 2244 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YFL019CYFL019C 354 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YBR012CYBR012C 420 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 SET3YKR029C 2256 nt1□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 BIR1YJR089W 2865 nt1□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 SLI15YBR156C 2097 nt1□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YJL135WYJL135W 318 nt1□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YPL185WYPL185W 396 nt1□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 NUP157YER105C 4176 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 STO1YMR125W 2586 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 BSC3YLR465C 309 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YOL014WYOL014W 375 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YOR199WYOR199W 330 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 SLD3YGL113W 2007 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YOR053WYOR053W 342 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 MMS4YBR098W 2076 nt0.97□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 ATG31YDR022C 591 nt0.97□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.97□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YNL058CYNL058C 951 nt0.97□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YOL160WYOL160W 342 nt0.97□□□□□ -2.25
UBX2Q04228 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.96□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.96□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YDR157WYDR157W 402 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 INP2YMR163C 2118 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 PDE2YOR360C 1581 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 SMC1YFL008W 3678 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 ALY2YJL084C 3141 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 IFH1YLR223C 3258 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 IRC23YOR044W 474 nt0.93□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YPL261CYPL261C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 PKH2YOL100W 3246 nt0.93□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YDL206WYDL206W 2289 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 CSN9YDR179C 489 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 RAD34YDR314C 2079 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 KAP120YPL125W 3099 nt0.91□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 GPG1YGL121C 381 nt0.91□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 RPS20YHL015W 366 nt0.91□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 CMC4YMR194C-B 222 nt0.91□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YOR121CYOR121C 306 nt0.91□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 WAR1YML076C 2835 nt0.9□□□□□ -2.26
UBX2Q04228 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.9□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 GEA2YEL022W 4380 nt0.9□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 NHP2YDL208W 471 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YDR521WYDR521W 336 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YLR334CYLR334C 381 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 RIM20YOR275C 1986 nt0.88□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YDR426CYDR426C 378 nt0.88□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.88□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.88□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YPR012WYPR012W 255 nt0.88□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 MAM33YIL070C 801 nt0.87□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 ULP2YIL031W 3105 nt0.87□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 CUL3YGR003W 2235 nt0.87□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 HMRA1YCR097W 381 nt0.86□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 RPL38YLR325C 237 nt0.86□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 RPL35AYDL191W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YGR035CYGR035C 351 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YIR044CYIR044C 186 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YJR011CYJR011C 786 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YAR053WYAR053W 297 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.84□□□□□ -2.27
UBX2Q04228 YDL196WYDL196W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 YLL007CYLL007C 1998 nt0.83□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 PAN2YGL094C 3348 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 PCC1YKR095W-A 267 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 YMR321CYMR321C 318 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 YAF9YNL107W 681 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 MYO1YHR023W 5787 nt0.81□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 NIP100YPL174C 2607 nt0.81□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 snR56snR56 88 nt0.8□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 GIM4YEL003W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 IES4YOR189W 351 nt0.8□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 RKR1YMR247C 4689 nt0.79□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 PTP2YOR208W 2253 nt0.79□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.78□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.78□□□□□ -2.28
UBX2Q04228 YPL225WYPL225W 441 nt0.78□□□□□ -2.28
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