Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.3□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 AIM29YKR074W 468 nt0.3□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YML108WYML108W 318 nt0.3□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 MCM10YIL150C 1716 nt0.3□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 SDH7YDR511W 402 nt0.29□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YBR206WYBR206W 324 nt0.29□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 ASE1YOR058C 2658 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 BSC3YLR465C 309 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 ZEO1YOL109W 342 nt0.28□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 RPL26BYGR034W 384 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YHL041WYHL041W 450 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YJR011CYJR011C 786 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 ULP2YIL031W 3105 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 FMP27YLR454W 7887 nt0.27□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YHR125WYHR125W 306 nt0.26□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 RPS24BYIL069C 408 nt0.26□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YPL044CYPL044C 549 nt0.26□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 NIP100YPL174C 2607 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 FYV10YIL097W 1551 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 OLI1Q0130 231 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 RPS20YHL015W 366 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 CUL3YGR003W 2235 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 INP2YMR163C 2118 nt0.25□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 MAM33YIL070C 801 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YIR044CYIR044C 186 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YLR287CYLR287C 1068 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YNR025CYNR025C 360 nt0.24□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 SBH1YER087C-B 249 nt0.23□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YAP6YDR259C 1152 nt0.22□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.22□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.22□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 RPL26AYLR344W 384 nt0.22□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 YPL229WYPL229W 621 nt0.22□□□□□ -2.37
UPS3Q04006 DIE2YGR227W 1578 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 CBS1YDL069C 690 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 ATG31YDR022C 591 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 BI2Q0110 1272 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 PAU12YGR294W 363 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YPL185WYPL185W 396 nt0.21□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 ESP1YGR098C 4893 nt0.2□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YHR130CYHR130C 336 nt0.2□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YKL083WYKL083W 615 nt0.2□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YNL058CYNL058C 951 nt0.2□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 AI1Q0050 2505 nt0.2□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 TRS65YGR166W 1683 nt0.18□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 FYV7YLR068W 456 nt0.18□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YNL122CYNL122C 348 nt0.18□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 snR54snR54 86 nt0.18□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 PET111YMR257C 2403 nt0.18□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 PTP2YOR208W 2253 nt0.17□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 PRP5YBR237W 2550 nt0.17□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YGR290WYGR290W 444 nt0.17□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 ISF1YMR081C 1017 nt0.17□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.16□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 BEM3YPL115C 3387 nt0.16□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 PCF11YDR228C 1881 nt0.16□□□□□ -2.38
UPS3Q04006 MYO1YHR023W 5787 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 OST4YDL232W 111 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YLR101CYLR101C 396 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YLR171WYLR171W 390 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YAR047CYAR047C 321 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YNL211CYNL211C 261 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 MRPL50YNR022C 420 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YOL014WYOL014W 375 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 VIK1YPL253C 1944 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 HAL9YOL089C 3093 nt0.15□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 PAA1YDR071C 576 nt0.14□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 TOM22YNL131W 459 nt0.14□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 SPO21YOL091W 1830 nt0.14□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 ECL1YGR146C 636 nt0.13□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 COX5BYIL111W 456 nt0.13□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.13□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 BIR1YJR089W 2865 nt0.12□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 IQG1YPL242C 4488 nt0.12□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YDR426CYDR426C 378 nt0.12□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 QCR9YGR183C 201 nt0.12□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.12□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 SEC8YPR055W 3198 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YMR321CYMR321C 318 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 snR41snR41 95 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 PRP42YDR235W 1635 nt0.11□□□□□ -2.39
UPS3Q04006 MLP1YKR095W 5628 nt0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms