Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms