Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER2P43116 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER2P43116 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms