Protein–RNA interactions for Protein: P38729

YHL042W, Putative uncharacterized protein YHL042W, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL042WP38729 RPL26BYGR034W 384 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 MAM33YIL070C 801 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 ISF1YMR081C 1017 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YBR206WYBR206W 324 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 snR54snR54 86 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 INP2YMR163C 2118 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 PMP1YCR024C-A 123 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 RPS24BYIL069C 408 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YJR011CYJR011C 786 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 BSC3YLR465C 309 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YPL261CYPL261C 309 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 NOP9YJL010C 2001 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 CUL3YGR003W 2235 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YCK3YER123W 1575 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 RPS20YHL015W 366 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YHL042WYHL042W 453 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YPL044CYPL044C 549 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YNL058CYNL058C 951 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YOR282WYOR282W 321 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 UBP3YER151C 2739 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 PRP16YKR086W 3216 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.31□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.3□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YNL303WYNL303W 348 nt0.3□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 PAN2YGL094C 3348 nt0.3□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 ATG31YDR022C 591 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YDR426CYDR426C 378 nt0.28□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.28□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 ATP19YOL077W-A 207 nt0.28□□□□□ -2.36
YHL042WP38729 YIR044CYIR044C 186 nt0.27□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.27□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YMR321CYMR321C 318 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YNL211CYNL211C 261 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 MRPL50YNR022C 420 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YOR218CYOR218C 420 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 snR189snR189 189 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 ASE1YOR058C 2658 nt0.25□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 FYV10YIL097W 1551 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 NIP100YPL174C 2607 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 SGF11YPL047W 300 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 PTP2YOR208W 2253 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 BEM3YPL115C 3387 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 PAU12YGR294W 363 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 FMP27YLR454W 7887 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 PET111YMR257C 2403 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YLR434CYLR434C 384 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YLR456WYLR456W 615 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YPL068CYPL068C 882 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 SPO21YOL091W 1830 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL042WP38729 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 PRP5YBR237W 2550 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 CSN9YDR179C 489 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 ANS1YHR126C 480 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 PAA1YDR071C 576 nt0.19□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 TAR1YLR154W-C 375 nt0.19□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 ABF2YMR072W 552 nt0.19□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 PCC1YKR095W-A 267 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YLR334CYLR334C 381 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 IQG1YPL242C 4488 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 OST4YDL232W 111 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 COX5BYIL111W 456 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YAR029WYAR029W 225 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YMR160WYMR160W 2451 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 LEE1YPL054W 906 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YPL225WYPL225W 441 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 YSP1YHR155W 3687 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 VIK1YPL253C 1944 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 ORC3YLL004W 1851 nt0.16□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 RPS25BYLR333C 327 nt0.16□□□□□ -2.38
YHL042WP38729 OST1YJL002C 1431 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 HMRA2YCR096C 360 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 YOR345CYOR345C 351 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 YPL185WYPL185W 396 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 PRP42YDR235W 1635 nt0.14□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.14□□□□□ -2.39
YHL042WP38729 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms