Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms