Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA3P25788 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms