Protein–RNA interactions for Protein: P23248

RPS1B, 40S ribosomal protein S1-B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	P23248	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YPL261C	YPL261C	309 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	OST4	YDL232W	111 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YER135C	YER135C	393 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YIR044C	YIR044C	186 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	RPS27A	YKL156W	249 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	snR45	snR45	172 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	THO2	YNL139C	4794 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YKL202W	YKL202W	582 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YMR321C	YMR321C	318 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	snR72	snR72	98 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	SSS1	YDR086C	243 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	HUR1	YGL168W	333 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YJR087W	YJR087W	351 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	PBI2	YNL015W	228 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	MYO1	YHR023W	5787 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	SPO21	YOL091W	1830 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YCR100C	YCR100C	951 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YIL029C	YIL029C	429 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YOL029C	YOL029C	606 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YGR025W	YGR025W	303 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YPL182C	YPL182C	384 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	LEE1	YPL054W	906 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	NFU1	YKL040C	771 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	DCP1	YOL149W	696 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YKL044W	YKL044W	321 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	YML108W	YML108W	318 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	IPP1	YBR011C	864 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	snR51	snR51	107 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPS1B	P23248	MAM33	YIL070C	801 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YAL066W	YAL066W	309 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	ISF1	YMR081C	1017 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	BUL2	YML111W	2763 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YNL146W	YNL146W	303 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	NNF2	YGR089W	2811 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YCR001W	YCR001W	315 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YOR345C	YOR345C	351 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	SDH7	YDR511W	402 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	RPS20	YHL015W	366 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YNL211C	YNL211C	261 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	SVS1	YPL163C	783 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	MPC1	YGL080W	393 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YKL136W	YKL136W	399 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YLR171W	YLR171W	390 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YAR053W	YAR053W	297 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
RPS1B	P23248	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	YDL016C	YDL016C	303 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	BER1	YLR412W	825 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	ATG31	YDR022C	591 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	NIP100	YPL174C	2607 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RPS1B	P23248	snR8	snR8	190 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	RPF1	YHR088W	888 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YNL058C	YNL058C	951 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YDL011C	YDL011C	324 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YHL041W	YHL041W	450 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	snR128	snR128	126 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	GRX5	YPL059W	453 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
RPS1B	P23248	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-0.4	□□□□□ -2.47

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