Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAP43P17677 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAP43P17677 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAP43P17677 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAP43P17677 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAP43P17677 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms