Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms