Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRB1P04280 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRB1P04280 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRB1P04280 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRB1P04280 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRB1P04280 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRB1P04280 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRB1P04280 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms