Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAP30O75446 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAP30O75446 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAP30O75446 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms