Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms