Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms