Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP290O15078 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CEP290O15078 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CEP290O15078 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CEP290O15078 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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