Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIMBP2O15034 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMBP2O15034 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms