Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGRNO00468 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGRNO00468 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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