Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIP1O00291 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIP1O00291 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIP1O00291 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIP1O00291 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIP1O00291 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIP1O00291 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIP1O00291 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIP1O00291 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms