Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HACD1B0YJ81 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms