Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL008626.1-201ENST00000412357 775 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PA2G4P4-201ENST00000473864 1182 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC009108.1-201ENST00000473913 796 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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