Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC091173.1-201ENST00000505627 2750 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SLC22A24-203ENST00000612278 2101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DYNC1I1-206ENST00000457059 2393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC01718-201ENST00000441660 391 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms