Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CFAP52-208ENST00000576499 711 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC022884.1-201ENST00000578490 577 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC103691.1-201ENST00000619654 520 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FP236315.1-201ENST00000623723 457 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 COPS5-201ENST00000357849 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR4N4-201ENST00000328795 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL117338.1-201ENST00000434552 631 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SAA3P-202ENST00000534768 642 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC023905.1-203ENST00000560180 765 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC099684.3-201ENST00000574483 560 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC135068.3-201ENST00000623441 1125 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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