Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB23Q9ULC3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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