Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms