Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK2Q9UBU2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms