Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms