Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms