Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf109Q9NX04 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms