Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC4Q9NTJ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms