Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSPNQ9HAW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms