Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms