Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms