Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSD3Q9BZ95 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD3Q9BZ95 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms